Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSD3Q9NYI0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSD3Q9NYI0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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