Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB20Q9NX57 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB20Q9NX57 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 403.8 ms