Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLE1Q9NVX2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLE1Q9NVX2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms