Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOMER2Q9NSB8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms