Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
STRN4Q9NRL3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRN4Q9NRL3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms