Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SAR1AQ9NR31 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAR1AQ9NR31 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms