Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
XPNPEP3Q9NQH7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms