Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
A4GALTQ9NPC4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
A4GALTQ9NPC4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms