Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPCPD1Q9NPB8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPCPD1Q9NPB8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms