Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VTA1Q9NP79 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTA1Q9NP79 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VTA1Q9NP79 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTA1Q9NP79 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTA1Q9NP79 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTA1Q9NP79 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTA1Q9NP79 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms