Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM8AQ9HCN3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms