Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DCLRE1BQ9H816 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1BQ9H816 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1BQ9H816 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1BQ9H816 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1BQ9H816 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1BQ9H816 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1BQ9H816 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DCLRE1BQ9H816 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1BQ9H816 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DCLRE1BQ9H816 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms