Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf49Q9H6J7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms