Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIPK3Q9H422 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIPK3Q9H422 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms