Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP44Q9H0E7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP44Q9H0E7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms