Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX4Q9BYU1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX4Q9BYU1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms