Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC3Q9BY71 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms