Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MS4A8Q9BY19 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MS4A8Q9BY19 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms