Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN1Q9BY11 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN1Q9BY11 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN1Q9BY11 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms