Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms