Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSM14BQ9BX40 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms