Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms