Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRNP25Q9BV90 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms