Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKNK1Q9BUB5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKNK1Q9BUB5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms