Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP2Q9BSJ2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms