Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms