Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF2Q9BQY4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms