Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERGIC2Q96RQ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms