Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A9Q96Q91 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A9Q96Q91 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms