Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LMTK3Q96Q04 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMTK3Q96Q04 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms