Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF558Q96NG5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms