Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF396Q96N95 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms