Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX27Q96L92 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX27Q96L92 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms