Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG1Q96JA1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms