Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VSIG2Q96IQ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms