Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGSM3Q96HU1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM3Q96HU1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM3Q96HU1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM3Q96HU1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM3Q96HU1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM3Q96HU1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM3Q96HU1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGSM3Q96HU1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGSM3Q96HU1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms