Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
BCANQ96GW7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
BCANQ96GW7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BCANQ96GW7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms