Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BICD1Q96G01 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms