Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUB1Q96FW1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms