Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MALSU1Q96EH3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MALSU1Q96EH3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms