Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM44Q96DX7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM44Q96DX7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms