Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ULK4Q96C45 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ULK4Q96C45 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ULK4Q96C45 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms