Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC59Q96AG4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRC59Q96AG4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms