Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UTP4Q969X6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UTP4Q969X6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms