Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJA10Q969M2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA10Q969M2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms