Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HPS3Q969F9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms