Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
SCAMP4Q969E2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCAMP4Q969E2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms