Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2A3Q93084 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2A3Q93084 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms