Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P3H4Q92791 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P3H4Q92791 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms