Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RGP1Q92546 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RGP1Q92546 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms